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防治措施针对芝棒污染原因和引发途径，生产上，要掌握灵芝品种的特征特性，提供适宜其生长的环境条件，规范操作，并贯彻为主的方针，避免或减少芝棒感染杂菌。选用优良品种，对退化品种进行提纯复壮选用抗病性强、生活力强、高纯度的菌种进行接种。经多年试验示范，以采收子实体为主的菌株“日本赤灵芝”，采芝、收粉兼用型菌株“黄山8号”两个优良菌株较适宜我省气候特点及段木熟料灵芝栽培模式，由于栽培多年，该两个品种有退化趋势，需进行提纯复壮。科学安排栽培季节根据中原地区气候特点，短段木灵芝菌棒制作期选在11月上旬至翌年2月上旬为宜，在此时段内，为让菌丝有足够的发菌时间，宜利用当地气候资源，提早制作菌棒。
相关研究发现，灵芝抱子的作用主要由多糖、三萜等有效成分起作用.例如，Fukuzawa等19研究发现灵芝抱子中含有16~20个碳的长链脂肪酸，能够抑制各种癌细胞的增殖；Liu等閃通过气相色谱检测出含16个、18个碳的脂肪酸，具有抑制癌细胞增殖的作用，Gao等回发现含有19个碳的脂肪酸也具有抑制癌细胞增殖的作用，Shen等因发现灵芝抱子可以通过调节肝细胞和几种相关免疫细胞的miRNA来抑制人肝癌细胞HepG2的增殖，从而达到治疗肝癌的目的，在测定的61个miRNA中,miR-3131的表达多，Li等阴观察灵芝抱子的超临界CO2提取物对离体胆管癌的影响，发现其能抑制离体胆管癌的迁移，其作用主要是通过抑制TGF-01诱发上皮间质转化（EMT）,从而抑制EMT胆管癌细胞的迁移.此外，其他相关研究还指出，灵芝抱子提取物对乳腺癌、前列腺癌、结肠癌等多种癌症治疗均有效果.
超声波法主要利用超声的空机械振动和空化效应来破坏灵芝抱子细胞壁.例如，Alzorqi等利用超声波提取P-D-葡聚糖,在优化条件下p-D-葡聚糖的产量为5.228mg/g．微波法．微波法利用微波的穿透能力和热效应，使细胞内部的温度迅速上升，从而使细胞内部的压力超过细胞壁膨胀所能承受的压力而破碎，促使其有效成分释放．例如，先将灵芝抱子进行微波处理，而后在低温深加工，灵芝抱子的破壁率可达99%以上．超临界提取法．超临界提取法利用气体在超临界状态下的性质,即流体的性质，使有效成分被流体萃取,Li等M运用超临界CO2萃取技术提取灵芝抱子，萃取率达到37%．机械法机械法的优点是操作简单、易行;缺点是机械设备投资大、运行成本较高．
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